最低稅負制主要是針對免稅所得加徵補充性稅捐，基本所得額在670萬元以下，沒有繳納基本稅額的問題。基本稅額要和應繳納的綜合所得稅額比較，綜合所得稅額高於基本稅額，繳納綜合所得稅額；基本稅額高於綜合所得稅額，則繳納基本稅額。
為使適用租稅減免規定而繳納較低稅負，或甚至不用繳稅的企業或高所得個人，都能繳納最基本的稅額，2006年起實施最低稅負制，使高所得者對國家財政均有基本的貢獻，以維護租稅公平，確保國家稅收。
列入最低稅負的4項所得包括海外所得、特定保險給付、私募基金受益憑證的交易所得，及非現金的捐贈扣除額。上述4類免稅所得加上綜合所得淨額就是基本所得額，基本所得額減去670萬元扣除額再乘以20％，就是基本稅額。
若納稅人屬我國居住者，有列入最低稅負的4項所得，基本所得額超過670萬元，而基本稅額大於一般綜合所得額，就要申報最低稅負，並依「基本稅額」繳稅。反之，就不用申報最低稅負。
安永稅務服務部會計師林志翔指出，最低稅負制中的特定保險給付，包括受益人與要保人非同一人的人壽保險金或年金保險，若全年總額3330萬元以下可免計入。
「最容易混淆的是海外所得」，林志翔說，海外所得含港澳但不含中國大陸所得，全年海外所得合計數未達100萬元者，不用計入基本所得額中計算；在100萬元以上者，應全數計入。
台北國稅局強調，海外所得在100萬元以上，不一定就得申報繳納基本稅額，要看基本所得額有沒有超過670萬元，及基本稅額有無大於綜合所額稅額。
台北國稅局表示，買國內發行的基金，申請買回時賺到的錢，屬中華民國來源的有價證券交易所得，免稅。如果是在國外發行的境外基金，基金的配息及申請買回時賺的錢，就是海外所得，若投資人是我國境內的居住者，就要依規定申報繳納基本稅額。
例如投資在台灣上市的香港ETF，配息部分是來自香港ETF分配的收益，所以是海外所得。而投資人在我國證交所買賣ETF所賺到的錢，是我國有價證券交易所得，免稅，不屬海外所得。
海外所得不申報 查到會挨罰
2016-04-24 聯合報 記者沈婉玉／台北報導
很多人都有共同疑問，海外所得是不是查不到？自己乖乖申報會不會反而自投羅網，讓稅捐機關掌握自己的海外財產？在國外已繳過的稅，可拿回台灣扣抵嗎？海外投資損失可以扣抵所得嗎？海外所得不申報被查到會怎樣？
台北國稅局表示，境內居住者如果有海外所得，要依所得基本稅額條例規定申報基本稅額，國稅局會依照所查得的資料核課納稅義務人的基本稅額。已依所得來源地法律規定繳納的所得稅，可扣抵基本稅額，但不能扣抵綜合所得稅額；扣抵數以加計該項所得而增加的基本稅額為限。
資誠會計師表示，國稅局可能會透過中央銀行結匯資料、透過金融機構結匯投資國外有價證券的銀行資料、外國公開資訊、國稅局過去稽查的紀錄、投審會對外投資核備相關資料及檢舉等方式，查到海外所得。
經由信託業者、證券商、銀行等國內金融機構投資海外，例如透過國內的基金或投顧公司購買境外基金，被國稅局查到的機率是百分百。因為，海外所得在50萬元以上，金融機構會將相關資料通報給國稅局。
台北國稅局表示，納稅人若沒有依規定申報基本稅額，除了補稅以外，有申報但漏報或短報，要罰漏稅額的2倍以下；沒申報者，要罰補稅額的3倍以下。
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